文化大革命中，洋泾中学遭受了难以抚平的创伤。许多资深老教师深受打击，离开了讲台，李玉华老师被造反学生迫害致死，学生荒废了学业。1968、69年，知识青年上山下乡的大潮中，连初中的同学也不得不远离亲人，奔赴安徽、崇明、黑龙江农村插队落户。薛振康老师清晰记得他到北站为学生送行，那一片哭天抢地、悲痛欲绝的场面令人耳不忍闻。

动荡的学校一直到1973年才恢复了正常课程。17岁起就在学校任教的沈兆祥老师回忆：文革结束重新评定市属重点中学的时候，“洋泾中学校园一片破败，没有一块完整的玻璃，没有一个完好的教室。洋泾中学是上海教育的重灾区。十年浩劫是教育事业的一场灾难，严重破坏了洋泾中学，教师、知识分子遭到迫害。这一代教师，在本该专心从事教学研究的时候荒废了黄金时代，学生更是可惜，大量人才被埋没了。”